Née du dieu marin des dangers des profondeurs cachées, Phorcys, et de la déesse des monstres marins et des dangers de la mer, Céto.
Méduse est la seule mortelle des trois Gorgones, avec ses sœurs immortelles.
 
Sa beauté lui valut d’être courtisée par Poséidon le dieu marin, mais elle refusa ses avances. Cependant, Poséidon, n’abandonnant pas, poursuivit Méduse sous la forme d’un oiseau, elle n’eut d’autre choix que de fuir jusqu’où elle le pouvait. Sa course l’amena jusque dans un temple d’Athéna où elle y trouva refuge.
 
Se pensant en sécurité, elle s’arrêta dans sa course, Poséidon entre alors dans le temple et abuse d'elle.

Athéna, furieuse face à cette insulte qui lui a été faite transforma Méduse en monstre comme ses sœurs et la condamna à un destin solitaire. Tous ceux qui croisent son regard seraient pétrifiés. Ainsi, on la surnomma également Gorgone par son apparence et ses origines.